| 全球最大的芯片制造商,同時也是計算機、網絡和通訊產品的領先制造商英特爾公司今天宣布,基于英特爾®架構的高性能計算（HPC）集群和服務器目前正在為亞太地區(qū)數(shù)十個新的生命科學和生物IT計劃提供強大動力。正在亞洲新興生命科學產業(yè)準備在今后5年大展宏圖之時,全球也正出現(xiàn)向經濟高效工業(yè)標準技術平臺的轉變,能夠加速生物IT技術發(fā)展的新型HPC超級計算機將登上舞臺。 因需要最大限度壓縮IT預算,亞洲數(shù)十個學術和科研機構不約而同地選擇了建立基于英特爾®架構的HPC集群或服務器,以便充分利用其高性價比的領先優(yōu)勢。最近實施部署的15個機構分別是墨爾本大學、昆士蘭州并行超級計算機基金會（澳大利亞）、香港浸會大學、香港大學生物信息和應用生物技術學院、印度科學院超級計算教育研究中心、印度技術研究所、印度科學與工業(yè)研究中心、清華大學生物信息研究所、新加坡基因研究所、新加坡南洋理工大學、新加坡生物信息學院、國立新加坡大學超級計算與可視化科學系、以及新加坡MIT聯(lián)合學校 、臺灣高雄市政府生物信息網格網絡。 清華大學在其信息科學與技術學院內成立了生物信息研究所。這是一所跨學科的研究所,人員和設施均來自該校生物系、技術科學系和自動化系。生物信息研究所的宗旨是使用基于最新英特爾至強處理器的集群系統(tǒng)從事尖端的生物信息研究,探索基因組排序/功能基因組表達等重大課題。清華大學高性能計算中心(參與了生物信息研究工作)主任, 計算機系教授鄭緯民介紹說：“清華大學基于144路英特爾至強處理器的集群系統(tǒng)為我們提供了高性能和經濟高效的解決方案,滿足了生物信息研究的苛刻計算要求。借助英特爾軟件工具和編譯器,我們能夠在英特爾架構集群系統(tǒng)上最大限度地發(fā)揮基因組排序算法的性能。” IDC估計,公共和私人投資者將向該地區(qū)的生命科學市場投入500億美元;到2006年,亞太地區(qū)的生物IT收入將達到26億美元,復合年增長率高達46%。IDC亞太地區(qū)生命科學總監(jiān)評價道：“我們看到目前亞洲存在兩大趨勢。首先,生命科學機構將高達50%的資本支出投入支持計劃所必需的‘技術積累’,他們一直需要更強大的計算能力來加速新的發(fā)現(xiàn)。其次,我們看到由于這個方興未艾的行業(yè)嘗試從其‘資本支出’投資中獲得最大回報,他們對于經濟高效、工業(yè)標準的HPC平臺產生越來越濃厚的興趣。 英特爾亞太區(qū)解決方案事業(yè)部地區(qū)總監(jiān)Jason Fedder先生今天在2003年BioITWorld香港年會上發(fā)表主題演講時稱：“生命科學行業(yè)對HPC強大計算能力不斷增長的需求將成為未來10年計算創(chuàng)新的主要推動力量。我們期待使用基于英特爾®安騰®2、英特爾®至強™和英特爾®奔騰®4處理器的開放標準構建模塊的英特爾架構集群和網格網絡能夠提供企業(yè)所需要的性能和經濟性�！� 2002年11月,英特爾曾經宣布正在將重點轉向生命科學領域。Fedder先生同時介紹了英特爾如何提供集成HPC解決方案,包括平臺架構、互連和網絡構建模塊、軟件工具和庫以及服務。 英特爾架構技術推動亞洲生命科學研究 最近至少有15個亞洲領先科研機構已經選擇了英特爾架構HPC集群或服務器,并已經投入運行或計劃投入運行,以幫助推進生命科學計劃。這些機構參與了各種計劃,從基因組排序、蛋白質合成和功能性基因學到中藥項目。 香港浸會大學數(shù)學系教授Fred J Hickernell說：“購買運行Linux**的英特爾架構集群使我們獲得了更強大的性能,我們還可以使用大量專門為這一環(huán)境開發(fā)的開發(fā)源代碼軟件�！痹撔Ｔ谥兴庮I域開展了多學科研究,包括中草藥的鑒別和分類、以及草藥的生物化學機制。這項研究需要進行持續(xù)的數(shù)據(jù)分析,戴爾**電腦公司為該系提供的基于英特爾®至強™處理器的新型雙路服務器的64節(jié)點集群正好可以大顯神通。 亞洲生物IT生態(tài)系統(tǒng)初露尖角 該項目由世界一流的學術小組領導,以海外研究所為依托,并得到了新一代專家級亞洲HPC解決方案提供商的大力支持。這些提供商中包括新加坡計算機系統(tǒng)的Linux評測中心和印度的CDC Linux。后者專門致力于為生命科學、計算流體動力學（CFD）及其它應用構建HPC解決方案。 日益流行的集群技術 集群技術正在風靡全球,同時在HPC部署的英特爾架構系統(tǒng)的數(shù)量也與日劇增。集群是一組相互聯(lián)網的獨立計算機,可以聯(lián)合處理問題。在全球前500名超級計算機排名***上,以前全被基于RISC的專有超級計算機所包攬,三年前僅在其中占有兩席之地的英特爾架構系統(tǒng)現(xiàn)在已達到了56款。 香港大學的Gideon 300集群在全球前500名超級計算機排名中位居第175,是亞太區(qū)第四大英特爾®架構超級計算機。Gideon集群由該大學的計算機科學與信息系統(tǒng)系（CSIS）用來執(zhí)行不同的研究計劃,包括涉及分子動態(tài)和N-人體模擬等的生命科學項目。 據(jù)CSIS負責人Francis Lau博士介紹：“在不到十年的時間里,計算機集群已發(fā)展成為解決復雜計算問題的最便捷、最經濟高效的工具。首先它能夠將足夠的計算循環(huán)集中到一個池中;其次,它能夠有效利用這些循環(huán),充分發(fā)揮出集群的聚合能力。業(yè)界必須進一步強化研發(fā)工作,使集群性能更為卓越,以處理最艱巨的挑戰(zhàn)�！� 英特爾安騰處理器系列與網格計算：HPC新浪潮 在亞洲的15個組織中,至少有5個選擇了全新的安騰架構系統(tǒng)。64位安騰處理器系列具有更出色的浮點性能、內存性能和大型數(shù)據(jù)集支持能力,能夠充分滿足科學研究人員的要求。幾家領先的全球研究機構已開始部署安騰架構系統(tǒng),包括美國國家超級計算應用中心（NCSA）、康奈爾理論中心和歐洲原子能研究組織（CERN）。NCSA目前正在部署基于安騰2架構系統(tǒng)的大型計算中心,不久即可完成10 teraflops（每秒一萬億次計算）集群的部署。 網格計算采用并擴展了HPC原理,將不同地點的臺式機、集群和大型對稱多處理（SMP）系統(tǒng)鏈接起來,使其變?yōu)橐粋�單一的虛擬計算資源。英特爾目前正在參與亞太區(qū)的全新網格網絡部署,包括新加坡生物醫(yī)學網格網絡和高雄市政府的生物信息網格網絡。 |
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