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“基因魔剪”有了脫靶突變檢測系統(tǒng)

  據英國《自然》雜志12日在線發(fā)表的一項基因編輯學研究,歐洲與美國科學家團隊報告稱:針對CRISPR-Cas9基因組編輯的全基因組脫靶效應的高效檢測系統(tǒng),在小鼠身上完成了測試。該研究成果將促進基因組編輯從研究到臨床的轉化。

  CRISPR-Cas9基因組編輯技術有“基因魔剪”之稱,被認為是人類醫(yī)學史上具有巨大潛力的創(chuàng)新技術,但只有在完全識別并消除額外的非目標(脫靶)突變時,這項技術才能真正實現(xiàn)臨床應用。

  所謂脫靶突變,指的是CRISPR-Cas9復合物附著在基因組的多位點上,并切割了錯誤的DNA片段。檢測這種突變的系統(tǒng)必須在體外以及整個生物體內都進行測試。

  此次,美國麻省總醫(yī)院以及瑞典阿斯利康公司的研究人員,描述了一種靈敏度較高的“體內脫靶驗證”(verification of in vivo off-targets,簡稱VIVO)系統(tǒng),可以檢測CRISPR-Cas9在生物體中的脫靶突變。VIVO系統(tǒng)會事先識別出潛在的脫靶位點,在基因組編輯后再確認這些位點中是否有位點發(fā)生了改變。研究團隊在小鼠肝臟中檢測了該系統(tǒng)的準確度,方法是設計出靶向小鼠體內Pcsk9基因的多種向導RNA(gRNA),包括混雜性(可以靶向多位點)的gRNA和特異性更高的gRNA。

  結果證實,VIVO系統(tǒng)不僅能檢測到混雜性gRNA誘導的數(shù)十種脫靶突變(包括發(fā)生率僅為0.13%的突變),而且正確設計的gRNA并不會帶來任何可檢測到的脫靶突變。

  研究人員認為,VIVO系統(tǒng)為定義基因組編輯在實際應用中的脫靶效應設立了重要標準,并證實了設計出特異性極高的gRNA的重要性。

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